Cechy kliniczne związane z mutacjami w genie chromosomu 1 z otwartym łukiem (GLC1A) cd

Mutacje zidentyfikowane w genie GLC1A, które zostały uznane za prawdopodobne mutacje wywołujące choroby. Tabela 2. Tabela 2. Zmiany sekwencji zidentyfikowane w genie GLC1A, które zostały uznane za mało prawdopodobne, aby wywołać mutacje powodujące choroby. Tabela 3. Tabela 3. Polimorfizmy, które nie zmieniły przewidywanej sekwencji aminokwasowej produktu genu GLC1A. Przeszukiwanie za pomocą analizy SSCP, a następnie sekwencjonowanie DNA od 1312 niespokrewnionych osobników (probantów, osobników z populacji ogólnej i normalnych kontroli) wykazało w sumie 35 zmian sekwencji w GLC1A. Sekwencjonowanie całego regionu kodującego GLC1A amplifikowanego z probantów z trzech rodzin z jaskrą połączoną z chromosomem 1q, ale bez nieprawidłowych SSCP ujawniło trzy dodatkowe zmiany sekwencji. Szesnaście z tych 38 wariantów sekwencji (Tabela 1) spełniało następujące kryteria prawdopodobnej mutacji związanej z chorobą: były obecne u lub więcej pacjentów z jaskrą iu mniej niż 1% ogólnej populacji, zmienili przewidywaną sekwencję aminokwasową i nie było ich w 91 normalnych osobach. Te 16 mutacji stwierdzono w 33 z 716 probantów z jaskrą (4,6 procent). Dziesięć z 38 zmian sekwencji zmieniło przewidywaną sekwencję aminokwasową GLC1A i zmieniło region flankujący 5 , ale uznano, że jest mało prawdopodobne, aby były mutacjami wywołującymi chorobę (Tabela 2) z jednego z następujących powodów: 3 występowały w więcej niż procent ogólnej populacji, 7 znaleziono w populacji ogólnej z częstotliwością większą niż częstotliwość w populacji z jaskrą, a znaleziono w tym samym allelu, co mutacja, która prawdopodobnie spowoduje chorobę. Jedenaście z 38 zmian sekwencji nie zmieniło przewidywanej sekwencji aminokwasowej GLC1A i dlatego też uznano, że nie są to mutacje powodujące choroby (Tabela 3). Skutki mutacji
Oceniono wpływ każdej z 26 zmian, które zmieniają sekwencję aminokwasową na polarność, ładunek i wielkość przewidywanego produktu genu. Wszystkie oprócz czterech zmian, które zmieniły polaryzację, ładunek lub rozmiar, zostały uznane za prawdopodobne mutacje powodujące choroby (Tabela 1). Łącznie, mutacje te znaleziono w 29 z 716 probantów (4,1 procent) i 5 z 596 osobników kontrolnych (0,8 procent) (P <0,001). Gdy powtórzyliśmy tę analizę przy użyciu tylko 563 probantów, 91 zdrowych osób i 184 osób z ogólnej populacji, którzy pochodzili z Iowa (którzy byli w związku z tym bardziej podobni do etnicznego pochodzenia), mutacje powodujące zmiany polarności, ładunku lub wielkość przewidywanego produktu genu stwierdzono w 24 z probantów (4,3 procent) i 2 z osób kontrolnych (0,7 procent) (P = 0,005).
Częstotliwość mutacji
Tabela 4. Tabela 4. Cechy kliniczne powiązane z sześcioma mutacjami GLC1A związanymi z jaskrą otwartego kąta. Sześć mutacji stwierdzono u więcej niż jednego pacjenta z jaskrą. Te sześć mutacji stwierdzono w 23 z 716 probantów. Analiza krewnych tych probantów zidentyfikowała dodatkowych 96 pacjentów z kliniczną diagnozą jaskry i mutacją w genie GLC1A. Kompletne dane kliniczne były dostępne dla 99 z tych 119 probantów i członków rodziny (Tabela 4)
[podobne: alemtuzumab, amiodaron, celiprolol ]
[podobne: barszcz zwyczajny a sosnowskiego różnice, seronegatywne zapalenie stawów, zespół moebiusa ]